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3ECM - 多肽结构

3ECM

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基本信息

PDB编号3ECM 前往RCSB ➚
标题Crystal structure of the unliganded PDE8A catalytic domain
实验方法X-RAY DIFFRACTION
分辨率1.90 Å
R-factorsR-work: 0.236, R-free: 0.265
发布日期2008-11-25
作者Wang, H.; Yan, Z.; Yang, S.; Cai, J.; Robinson, H.; Ke, H.
来源生物Homo sapiens
表达宿主Escherichia coli
基因名称PDE8A
关键词Phosphodiesterase 8A PDE8A inhibitor selectivity, Alternative splicing, cAMP, Hydrolase, Magnesium, Manganese, Metal-binding
EC编号3.1.4.17, 3.1.4.53
分子量39.18 kDa
实体数量蛋白质: 1, 核酸: 0, 核酸杂合体: 0
空间群C 2 2 21
晶胞参数a=76.26 Å, b=132.66 Å, c=101.52 Å, α=90.00°, β=90.00°, γ=90.00°
二硫键Yes
其他连接Yes
蛋白链A
蛋白长度338

序列信息

链: A - High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A (长度: 338)

1DDVPPRIARA MENEEYWDFD IFELEAATHN RPLIYLGLKM FARFGICEFL HCSESTLRSW
61LQIIEANYHS SNPYHNSTHS ADVLHATAYF LSKERIKETL DPIDEVAALI AATIHDVDHP
121GRTNSFLCNA GSELAILYND TAVLESHHAA LAFQLTTGDD KCNIFKNMER NDYRTLRQGI
181IDMVLATEMT KHFEHVNKFV NSINKPLATL EENGETDKNQ EVINTMLRTP ENRTLIKRML
241IKCADVSNPC RPLQYCIEWA ARISEEYFSQ TDEEKQQGLP VVMPVFDRNT CSIPKSQISF
301IDYFITDMFD AWDAFVDLPD LMQHLDNNFK YWKGLDEM

参考文献

Kinetic and structural studies of phosphodiesterase-8A and implication on the inhibitor selectivity

Wang, H., Yan, Z., Yang, S., Cai, J., Robinson, H., Ke, H.

Biochemistry, 2008

配体信息

ID 名称 化学式 分子量
ZNZINC IONZn65.409
MGMAGNESIUM IONMg24.305

生物组装

组装 ID: 1

详情: author_and_software_defined_assembly

寡聚状态: Monomer

化学计量: A1

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