多肽结构数据库

关于我们的环肽数据库：Cyclic Peptide DataBank (CPDB)

欢迎访问环肽数据库（Cyclic Peptide DataBank, CPDB）—— 一个专注于含二硫键环肽三维结构的综合性知识库。

环肽，特别是含有二硫键的环肽，因其独特的结构稳定性、高靶点亲和力和出色的生物活性，已成为现代生物学研究的前沿和创新药物开发的关键来源。然而，这些复杂分子的三维结构信息分散在海量的文献和多个数据库中，给科研人员的系统性研究带来了巨大挑战。

为了应对这一挑战，我们创建了CPDB。本数据库致力于系统性地收集、整理和高精度地展示包含至少一个二硫键的环肽三-维结构数据。我们希望能打破数据壁垒，为全球的计算生物学家、结构生物学家、药物化学家及相关领域的科研人员提供一个全面、精确、直观且易于访问的环肽结构信息平台。

本数据库的核心特色与功能：

• 全面的数据收录： 系统性整合来自蛋白质数据库（PDB）及已发表文献中的含二硫键环肽结构，并提供详尽的来源信息和交叉引用链接。
• 精准的结构注释： 对每一条目进行精细的生物和化学信息注释，包括序列、分子量、二硫键连接方式、来源物种、生物活性及相关的靶点信息。
• 强大的检索系统： 提供基于关键词、序列、分子式、来源或靶点的多维度、高级检索功能，帮助用户快速定位感兴趣的分子。
• 交互式三维可视化： 内嵌先进的分子可视化工具，用户可以直接在网页上对环肽的三维结构进行旋转、缩放、高亮显示二硫键和不同残基等交互式操作。
• 便捷的数据下载： 所有结构数据及相关信息均支持一键下载，提供多种常用格式（如 PDB, MOL2, SDF），以无缝对接主流的分子模拟和药物设计软件。

我们相信，CPDB不仅是一个数据存储库，更是一个激发创新、加速研究的催化剂。无论您是致力于探索新的天然产物，还是在设计下一代肽类药物，本数据库都将为您提供宝贵的结构信息支持。

关于我们

本数据库由清华大学北京生物结构前沿研究中心的团队负责开发和长期维护。

北京生物结构前沿研究中心（Beijing Advanced Innovation Center for Structural Biology）由清华大学与北京市科学技术委员会于2018年联合共建。作为北京市为构建高精尖经济结构而设立的新型研发机构，中心的核心使命是：聚焦世界科技前沿，充分发挥结构生物学作为生命科学"利器"的独特优势，推动其与计算科学、化学生物学等领域的深度交叉融合。

我们致力于攻克生命科学中的关键核心技术瓶颈，并勇于挑战"从0到1"的基础科学难题。建立该环肽数据库，正是我们履行这一使命的具体实践。它不仅是中心科研成果的转化，更是我们服务于全球科研社区，推动结构生物学知识共享与应用，共同促进人类健康事业发展的承诺。

我们诚挚地邀请您使用本数据库，并欢迎您提出宝贵的反馈与建议，帮助我们不断完善。让我们共同探索环肽这一迷人分子世界的无限可能。