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2H40 - 多肽结构

2H40

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基本信息

PDB编号2H40 前往RCSB ➚
标题Crystal structure of the catalytic domain of unliganded PDE5
实验方法X-RAY DIFFRACTION
分辨率1.85 Å
R-factorsR-work: 0.221, R-free: 0.236
发布日期2006-06-06
作者Wang, H.; Liu, Y.; Huai, Q.; Cai, J.; Zoraghi, R.; Francis, S.H.; Corbin, J.D.; Robinson, H.; Xin, Z.; Lin, G.; Ke, H.
来源生物Homo sapiens
表达宿主Escherichia coli BL21
基因名称PDE5, PDE5A
关键词PDE5, unliganded, HYDROLASE
EC编号3.1.4.35
分子量37.88 kDa
实体数量蛋白质: 1, 核酸: 0, 核酸杂合体: 0
空间群P 31 2 1
晶胞参数a=74.73 Å, b=74.73 Å, c=130.69 Å, α=90.00°, β=90.00°, γ=120.00°
二硫键Yes
其他连接Yes
蛋白链A
蛋白长度326

序列信息

链: A - cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase (长度: 326)

1EETRELQSLA AAVVPSAQTL KITDFSFSDF ELSDLETALC TIRMFTDLNL VQNFQMKHEV
61LCRWILSVKK NYRKNVAYHN WRHAFNTAQC MFAALKAGKI QNKLTDLEIL ALLIAALSHD
121LDHRGVNNSY IQRSEHPLAQ LYCHSIMEHH HFDQCLMILN SPGNQILSGL SIEEYKTTLK
181IIKQAILATD LALYIKRRGE FFELIRKNQF NLEDPHQKEL FLAMLMTACD LSAITKPWPI
241QQRIAELVAT EFFDQGDRER KELNIEPTDL MNREKKNKIP SMQVGFIDAI CLQLYEALTH
301VSEDCFPLLD GCRKNRQKWQ ALAEQQ

参考文献

Multiple Conformations of Phosphodiesterase-5: Implications for enzyme function and drug development

Wang, H., Liu, Y., Huai, Q., Cai, J., Zoraghi, R., Francis, S.H., Corbin, J.D., Robinson, H., Xin, Z., Lin, G., Ke, H.

J Biological Chem, 2006

配体信息

ID 名称 化学式 分子量
ZNZINC IONZn65.409
MGMAGNESIUM IONMg24.305

生物组装

组装 ID: 1

详情: author_and_software_defined_assembly

寡聚状态: Monomer

化学计量: A1

组装 ID: 2

详情: software_defined_assembly

寡聚状态: Homo 2-mer

化学计量: A2

3D 结构可视化